RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514421.1

CCL28-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 3

Gene CCL28, Length 577 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-204ENST00000514421 OR56B4Q8NH76 319 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 Q8TCH9 128 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 AQP3Q92482 292 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 SPSB1Q96BD6 273 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MED30Q96HR3 178 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TECTBQ96PL2 329 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 GHITMQ9H3K2 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TMEM165Q9HC07 324 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RNF7Q9UBF6 113 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 KLK11Q9UBX7 282 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 JMJD1CQ15652 2540 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 B4DSR2 109 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PPIAL4DF5H284 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 WNT9BO14905 357 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RBBP9O75884 186 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FSTL3O95633 263 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TGFAP01135 160 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 IGHV2-70P01814 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 GRPP07492 148 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CHRM2P08172 466 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CPT2P23786 658 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MPZP25189 248 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 IL2RGP31785 369 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ACTBP60709 375 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ACTG1P63261 375 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PRDX4Q13162 271 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MPPED2Q15777 294 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 UBE2V2Q15819 145 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MOB3CQ70IA8 216 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 SPICQ8N5J4 248 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.98□□□□□ -1.29
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CCL28-204ENST00000514421 POM121Q96HA1 1249 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RNF170Q96K19 258 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 GAL3ST1Q99999 423 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ALG5Q9Y673 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ZFHX3Q15911 3703 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 TMEM210A6NLX4 147 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CDIPTO14735 213 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PRAF2O60831 178 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CA11O75493 328 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CCNKO75909 580 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 NDUFB6O95139 128 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 DHFRP00374 187 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CD74P04233 296 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CFHR2P36980 270 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 PTGFRP43088 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ZP1P60852 638 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 ZMYND11Q15326 602 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 KISS1Q15726 138 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL28-204ENST00000514421 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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