RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	C1QB	P02746	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CSF3	P09919	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SPN	P16150	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KLK7	P49862	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GNG5	P63218	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		Q6ZPA2	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PITX2	Q99697	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	XKRY	O14609	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CHST10	O43529	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RDH16	O75452	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DHRS3	O75911	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TTR	P02766	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HBG1	P69891	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HBG2	P69892	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PRDX4	Q13162	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		Q6YL49	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		V9GY05	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IFNA10	P01566	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CELA2A	P08217	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FHL2	Q14192	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	METTL26	Q96S19	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CCDC22	O60826	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DPT	Q07507	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GALM	Q96C23	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		A0A0U1RQV1	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ATP5G1	P05496	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ATF1	P18846	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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