RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-12P01611 117 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 VSIG8P0DPA2 414 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 RAB6AP20340 208 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 BCL3P20749 454 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINA2P20848 420 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PMELP40967 661 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK11-1P61568 191 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 OSR2Q8N2R0 312 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 Q8NFD4 153 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 CMTM3Q96MX0 182 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 JMJD8Q96S16 334 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A7Q99884 636 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 GLS2Q9UI32 602 aa9.46□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0B4J203 849 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM178BH3BS89 294 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 J3QLI3 93 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 RGS5O15539 181 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 MPIG6BO95866 241 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PAHP00439 452 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SFTPBP07988 381 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 MGMTP16455 207 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PRKACAP17612 351 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 NPBWR2P48146 333 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FGF12P61328 243 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 LCN2P80188 198 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 QRFPP83859 136 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 NANPQ8TBE9 248 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PHF21AQ96BD5 680 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF488Q96MN9 340 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 HMG20AQ9NP66 347 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.45□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM89A2RUT3 159 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A10PA6NDY2 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A7PA6NKC0 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PPIAL4DF5H284 164 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 LGALS8O00214 317 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SH2D1BO14796 132 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 LDLRAD4O15165 306 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SCGNO76038 276 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 CPT2P23786 658 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 S100A5P33763 92 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 GMFBP60983 142 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 KCNJ8Q15842 424 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 MICBQ29980 383 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00596Q86U02 117 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM104Q8NE00 496 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.44□□□□□ -0.9
UBE2B-208ENST00000511807 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms