RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR5H1A6NKK0 313 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GPR37O15354 613 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBTB25P24278 435 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRDX4Q13162 271 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACER2Q5QJU3 275 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PET117Q6UWS5 81 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DAOP14920 347 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASCL1P50553 236 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VAX2Q9UIW0 290 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NXPH1P58417 271 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MICBQ29980 383 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM209BQ5JX69 171 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VSTM2LQ96N03 204 aa15.99■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FSTP19883 344 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CT45A10P0DMU9 189 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AQP7P3A6NL99 342 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WNT16Q9UBV4 365 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRSS50Q9UI38 385 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KHDC3LQ587J8 217 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 K7EQS6 105 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C1QCP02747 245 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASB10Q8WXI3 467 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VDAC1P21796 283 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MMP16P51512 607 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MLF1P58340 268 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFNB2P52799 333 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHRS13Q6UX07 377 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZAR1Q86SH2 424 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CARFQ8N187 725 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BET1LQ9NYM9 111 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR10J1P30954 320 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PATE4P0C8F1 98 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GNB4Q9HAV0 340 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A0A1W2PPV9 198 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EML2O95834 649 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSN1S1P47710 185 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DYNLT3P51808 116 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR10D3Q8NH80 312 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIAA1456Q9P272 454 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SOCS1O15524 211 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VSIG8P0DPA2 414 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGFBP7Q16270 282 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HOGA1Q86XE5 327 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STARD10Q9Y365 291 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SNX22Q96L94 193 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SARGQ9BW04 601 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HRASP01112 189 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HLA-GP17693 338 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CA6P23280 308 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR6X1Q8NH79 312 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAV17A0A0B4J275 112 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HRKO00198 91 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms