RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 MMP28Q9H239 520 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 A6NDX4 124 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 SYT7O43581 403 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ALX3O95076 343 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ISG15P05161 165 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 MPZP25189 248 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ODF4Q2M2E3 257 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CLVS2Q5SYC1 327 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 MRAPQ8TCY5 172 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 NXPH2O95156 264 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 RAB13P51153 203 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ERVK11-1P61568 191 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PLA1AQ53H76 456 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ZNF626Q68DY1 528 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 STX19Q8N4C7 294 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR52N1Q8NH53 320 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 MALSU1Q96EH3 234 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR4F4Q96R69 305 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 GPR173Q9NS66 373 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 E9PI62 339 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 K7N7A8 449 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 RBP4P02753 201 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ARG1P05089 322 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CCDC159P0C7I6 412 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 TMEM219Q86XT9 240 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 BATF2Q8N1L9 274 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 R3HDM4Q96D70 268 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 SCN3BQ9NY72 215 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PITPNC1Q9UKF7 332 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 DYNLT3P51808 116 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 LOXL3P58215 753 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CCDC58Q4VC31 144 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 RDH10Q8IZV5 341 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PHF21AQ96BD5 680 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 C10orf35Q96D05 121 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 CNBD2Q96M20 576 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PKIBQ9C010 78 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.02■□□□□ 0.16
NELFE-212ENST00000492539 TMEM212A6NML5 194 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ZNF737O75373 536 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 CDK1P06493 297 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ZNF728P0DKX0 622 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 COL10A1Q03692 680 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 IL24Q13007 206 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 SSX2Q16385 188 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 RNLSQ5VYX0 342 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ZNF485Q8NCK3 441 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 MYDGFQ969H8 173 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 Q9H521 79 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 HHLA2Q9UM44 414 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 H3BSH0 61 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 MYL12BO14950 172 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ZFPL1O95159 310 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 IGHV1-8P0DP01 117 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 SLC35A2P78381 396 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 CDK5R1Q15078 307 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 Q6ZS46 218 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 TCF23Q7RTU1 214 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 OR5AK2Q8NH90 309 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 SGCDQ92629 289 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 COMMD4Q9H0A8 199 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NELFE-212ENST00000492539 DNAH9Q9NYC9 4486 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms