RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 ZNF561Q8N587 486 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MYDGFQ969H8 173 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 RFT1Q96AA3 541 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SNX22Q96L94 193 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OPALINQ96PE5 141 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 GAFA1Q96PS6 74 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 DUX5Q96PT3 197 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 KPTNQ9Y664 436 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ATRQ13535 2644 aa5.5□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.539e-8■■■■■ 29.1
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SDHB-208ENST00000491274 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 A0A1W2PRD5 423 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 A0A1W2PRF3 423 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 A0A1W2PRM7 423 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 H0YJX3 145 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SH2D1BO14796 132 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SULT1B1O43704 296 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PRKACAP17612 351 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 GABRR1P24046 479 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MPZP25189 248 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 DUSP1P28562 367 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 AQP4P55087 323 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CAV3P56539 151 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 EDDM3BP56851 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TAS2R43P59537 309 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 BPIFB3P59826 476 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 HILS1P60008 231 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 COL10A1Q03692 680 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CDK5R1Q15078 307 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 USP43Q70EL4 1123 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PHC2Q8IXK0 858 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CD177Q8N6Q3 437 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OR52N1Q8NH53 320 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 GHSRQ92847 366 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SDSLQ96GA7 329 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SPACA5Q96QH8 159 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TBX15Q96SF7 602 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 S100A13Q99584 98 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ZNF649Q9BS31 505 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CKLFQ9UBR5 152 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 DYSFO75923 2080 aa5.49□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 F8VVB4 439 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 F8VWA3 439 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 DEGS1O15121 323 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 OGG1O15527 345 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 HAND1O96004 215 aa5.48□□□□□ -1.53
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SDHB-208ENST00000491274 FSHBP01225 129 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 IGHV1-69P01742 117 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 MT-ND2P03891 347 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 TK1P04183 234 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CRYBA1P05813 215 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CD1AP06126 327 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ZNF44P15621 663 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 CELP19835 753 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 BCL3P20749 454 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 NPBWR2P48146 333 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 HSPA13P48723 471 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 WNT4P56705 351 aa5.48□□□□□ -1.53
SDHB-208ENST00000491274 ERVK11-1P61568 191 aa5.48□□□□□ -1.53
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