RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AQP3	Q92482	292 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRGN	Q92686	78 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM63	Q969Q1	353 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF170	Q96K19	258 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLQ	O75417	2590 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPE	Q02224	2701 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HS3ST1	O14792	307 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRY3	O43610	288 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTAG2	O75638	210 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLPX	O76031	633 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY6H	O94772	140 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD2	P06729	351 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF12	P17014	697 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUBG1	P23258	451 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPZ	P25189	248 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU3F4	P49335	361 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVX1	P49640	407 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTCP1	P56278	107 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM50B	P56557	158 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFITM3	Q01628	133 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFNB3	Q15768	340 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB11B	Q15907	218 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF79	Q15937	498 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF404	Q494X3	552 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM201A	Q5SY85	155 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLAMF9	Q96A28	289 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RITA1	Q96K30	269 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NICN1	Q9BSH3	213 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BANF2	Q9H503	90 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPA3	Q9H6K4	179 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM100	Q9NV29	134 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		V9GYH0	126 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP6	Q13023	2319 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPG11	Q96JI7	2443 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3QRK9	145 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRY	O14603	147 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDIPT	O14735	213 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDCD5	O14737	125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHB	P01229	141 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD55	P08174	381 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HCK	P08631	526 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYNX1	P0DP58	116 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL3	P20749	454 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKACB	P22694	351 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTR2C	P28335	458 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCH1	P30793	250 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD200	P41217	278 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAAO	P46952	286 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTH2R	P49190	550 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF81	P51508	661 aa		5.13	□□□□□ -1.59

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