RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	CD34	P28906	385 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IFNGR2	P38484	337 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RAB7A	P51149	207 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CRYBA2	P53672	197 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SMIM11A	P58511	58 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	VSNL1	P62760	191 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DGCR6	Q14129	220 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HES1	Q14469	280 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RPE	Q96AT9	228 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		H0Y980	276 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		J3QT63	122 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CXCR6	O00574	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MGST3	O14880	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TFF1	P04155	84 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SPARC	P09486	303 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GLIPR1	P48060	266 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GZMM	P51124	257 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	VAMP2	P63027	116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PITPNA	Q00169	270 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HAGH	Q16775	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		A0A0U1RQV5	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		I3L521	148 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FFAR1	O14842	300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF737	O75373	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ARSB	P15848	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MPZ	P25189	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PSMB8	P28062	276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HAAO	P46952	286 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OMP	P47874	163 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZP1	P60852	638 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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