RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 RAC2P15153 192 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CBR1P16152 277 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CXCL2P19875 107 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 COX5AP20674 150 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SSTR2P30874 369 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HAAOP46952 286 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 NPY4RP50391 375 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HERV-K104P61576 105 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TCF15Q12870 199 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SMCO1Q147U7 214 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 P2RY6Q15077 328 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GUSBP1Q15486 140 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C3AR1Q16581 482 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CFAP161Q6P656 301 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 KCTD9Q7L273 389 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MDP1Q86V88 176 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SPERTQ8NA61 448 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C2orf50Q96LR7 162 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TRIB1Q96RU8 372 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 IFT22Q9H7X7 185 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TREM2Q9NZC2 230 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GPR160Q9UJ42 338 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 STARD10Q9Y365 291 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 AUP1Q9Y679 476 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 LRP5LA4QPB2 252 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF732B4DXR9 585 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TM4SF5O14894 197 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 BCL2L11O43521 198 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 WDR1O75083 606 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MPC2O95563 127 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RLN2P04090 185 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TK1P04183 234 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SFTPBP07988 381 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF728P0DKX0 622 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SERPINF1P36955 418 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1CBP62140 327 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 NAAAQ02083 359 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SHEQ5VZ18 495 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 BEND4Q6ZU67 534 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SSX8Q7RTT4 187 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 LRTM2Q8N967 370 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PRSS33Q8NF86 280 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 EXTL1Q92935 676 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GALNT14Q96FL9 552 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF75AQ96N20 296 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 LUZP4Q9P127 313 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GLS2Q9UI32 602 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PROCRQ9UNN8 238 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.68□□□□□ -1.5
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