RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485939.5

BBX-225, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-225	ENST00000485939	ENTPD6	O75354	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DHRS3	O75911	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IFNG	P01579	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SPN	P16150	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC2A5	P22732	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IFNGR2	P38484	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	REG1B	P48304	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HMGA2	P52926	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	P2RX3	P56373	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	AES	Q08117	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IL24	Q13007	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IL18R1	Q13478	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SNCB	Q16143	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	LTC4S	Q16873	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	STPG2	Q8N412	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	COQ2	Q96H96	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SNX22	Q96L94	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RETN	Q9HD89	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939		V9GYS6	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939		H3BN98	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GSC2	O15499	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGHG2	P01859	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TMEM11	P17152	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PRKACA	P17612	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	NFYB	P25208	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PEX2	P28328	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	BRS3	P32247	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	POU3F4	P49335	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GNG10	P50151	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SCAND1	P57086	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GNB1	P62873	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CBX1	P83916	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FHL3	Q13643	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	APOF	Q13790	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DOC2B	Q14184	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HES1	Q14469	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GINS1	Q14691	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PKIB	Q9C010	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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