RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR8S1Q8NH09 359 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 HAS2Q92819 552 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ADGRG7Q96K78 797 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PHB2Q99623 299 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TM2D1Q9BX74 207 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OPN4Q9UHM6 478 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GPR132Q9UNW8 380 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 A0A0B4J2A0 478 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 A0A0D9SG52 128 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TMEM235A6NFC5 223 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 F5H5K5 113 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 H3BSH0 61 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 LGALS8O00214 317 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 AKR7A2O43488 359 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 XRCC2O43543 280 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SPRY2O43597 315 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RAMP1O60894 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SYNGR4O95473 234 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MT-CO3P00414 261 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CD8AP01732 235 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OPN1LWP04000 364 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SPP1P10451 314 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 COX5BP10606 129 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ITGA3P26006 1051 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 GDF1P27539 372 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PMELP40967 661 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 CXADRP78310 365 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PLA2G7Q13093 441 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 UNC119Q13432 240 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 KISS1Q15726 138 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ESCO2Q56NI9 601 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 BIVMQ86UB2 503 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ACBD4Q8NC06 268 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 BEX1Q9HBH7 125 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 COMMD9Q9P000 198 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 KIF25Q9UIL4 384 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-208ENST00000482558 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF724A8MTY0 619 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SMLR1H3BR10 107 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 WRBO00258 174 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SYNGR3O43761 229 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RP2O75695 350 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TRAPPC6AO75865 159 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ACTL6AO96019 429 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF806P0C7X5 589 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SLC25A4P12235 298 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PTHLHP12272 177 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CD59P13987 128 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PPP3CBP16298 524 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ABOP16442 354 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CRYGSP22914 178 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CD34P28906 385 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CALCRP30988 508 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 S100A11P31949 105 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 DLSTP36957 453 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ASCL1P50553 236 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 Q0VFX4 171 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF345Q14585 488 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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