RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN26Q16670 478 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 KRT74Q7RTS7 529 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 RNF144BQ7Z419 303 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS12Q96DT0 336 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 MALSU1Q96EH3 234 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 PELI1Q96FA3 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 AJUBAQ96IF1 538 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 Q96MT0 163 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 DHDHQ9UQ10 334 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 FUOMA2VDF0 154 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 H3BNX3 289 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 MGST3O14880 152 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 MMP23AO75900 390 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 CD28P10747 220 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 HTR1DP28221 377 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 GLP1RP43220 463 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR3A1P47881 315 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR3A4PP47883 348 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 GLIPR1P48060 266 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 EFNB2P52799 333 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 DLX6P56179 175 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 P2RX3P56373 397 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 BLCAPP62952 87 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OCLNQ16625 522 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF626Q68DY1 528 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 PIFOQ8TCI5 191 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 SPSB1Q96BD6 273 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf35Q96D05 121 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 R3HDM4Q96D70 268 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 MBOAT4Q96T53 435 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 HMG20AQ9NP66 347 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 TCF19Q9Y242 345 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 PLXNB1O43157 2135 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ODF3BA8MYP8 253 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 E9PI62 339 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 G3V4G9 280 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 EBAG9O00559 213 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 HTR3BO95264 441 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV1D-12P01611 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ISG15P05161 165 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 PTGFRP43088 359 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 CCR9P51686 369 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGDIBP52566 201 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 IL18R1Q13478 541 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 GALEQ14376 348 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 RSU1Q15404 277 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 AANATQ16613 207 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 OR52W1Q6IF63 320 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf88Q6PI97 169 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-209ENST00000480420 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms