RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TMEM89A2RUT3 159 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MEGF11A6BM72 1044 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 NPFFO15130 113 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ANGPTL7O43827 346 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 INMTO95050 263 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LALBAP00709 142 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TFF1P04155 84 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CSN2P05814 226 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF728P0DKX0 622 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GABRR1P24046 479 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PTGFRP43088 359 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SLC35A2P78381 396 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FOXL1Q12952 345 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DOC2BQ14184 412 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RSU1Q15404 277 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SPHARQ15513 63 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GRK1Q15835 563 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DDI2Q5TDH0 399 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C16orf87Q6PH81 154 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ASCL4Q6XD76 172 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SATL1Q86VE3 508 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 BATF2Q8N1L9 274 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF14Q92956 283 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RFT1Q96AA3 541 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 Q9H521 79 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DUSP21Q9H596 190 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 BTBD17A6NE02 478 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C17orf98A8MV24 154 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 H3BUI4 141 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RGS10O43665 173 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ATP6V1G2O95670 118 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR2H2O95918 312 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PAHP00439 452 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-12P01611 117 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CRYBA1P05813 215 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TGFBR2P37173 567 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 VHLP40337 213 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RANBP1P43487 201 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 KCNJ3P48549 501 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IL13RA2Q14627 380 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TRAM1Q15629 374 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LINC00596Q86U02 117 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF714Q96N38 554 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 METTL9Q9H1A3 318 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GUS0 222 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TMEM82A0PJX8 343 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GABRPO00591 440 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DEGS1O15121 323 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MELTFP08582 738 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 HKR1P10072 659 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF44P15621 663 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CRHBPP24387 322 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LGALS4P56470 323 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MED22Q15528 200 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 AANATQ16613 207 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR52W1Q6IF63 320 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PRSS48Q7RTY5 328 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR51A2Q8NGJ7 313 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR5R1Q8NH85 324 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DYRK2Q92630 601 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR14A2Q96R54 314 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FAM192AQ9GZU8 254 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms