RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	SELENOV	P59797	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GMFB	P60983	142 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN5	P62079	268 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK10	Q15131	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CA10	Q9NS85	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2AT4	A6NND4	320 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DEGS1	O15121	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SPRY3	O43610	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MPPED2	Q15777	294 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6P435	159 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MED30	Q96HR3	178 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRPB1	O00241	398 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	HS3ST1	O14792	307 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2H2	O95918	312 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GLA	P06280	429 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GLRA1	P23415	457 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FPR2	P25090	351 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF146	Q15072	292 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6ZPA2	131 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RDH5	Q92781	318 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	WNT9B	O14905	357 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	HAND1	O96004	215 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	NAPSA	O96009	420 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4E1	P0C645	316 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF81	P51508	661 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	SORD	Q00796	357 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	GRK1	Q15835	563 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HDLBP-231	ENST00000467435	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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