RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.92■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 CMBLQ96DG6 245 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.92■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 OR52W1Q6IF63 320 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 ST8SIA4Q92187 359 aa15.9■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR2AT4A6NND4 320 aa15.9■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 STPG2Q8N412 459 aa15.9■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.9■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FABP6P51161 128 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ARL6IP1Q15041 203 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM17Q86X19 198 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 OR10K1Q8NGX5 313 aa15.89■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PP6455Q8WZ26 134 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ARPC5LQ9BPX5 153 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 NRASP01111 189 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PMP2P02689 132 aa15.88■□□□□ 0.13
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