RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CD34P28906 385 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 APLNRP35414 380 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ3P48549 501 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NPY4RP50391 375 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TDGF1P3P51864 188 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 UCP3P55916 312 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN5P62079 268 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1CBP62140 327 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GNG3P63215 75 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TGFBR3Q03167 851 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MALLQ13021 153 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IL13RA2Q14627 380 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OPCMLQ14982 345 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 P2RY6Q15077 328 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MPV17LQ2QL34 196 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ALKBH6Q3KRA9 238 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SHEQ5VZ18 495 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00596Q86U02 117 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 Q8NA96 180 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NAXEQ8NCW5 288 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MAFIPQ8WZ33 124 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 DYRK2Q92630 601 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TRIB1Q96RU8 372 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 S100A13Q99584 98 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NRIP2Q9BQI9 281 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 HES4Q9HCC6 221 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TUBG2Q9NRH3 451 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EHFQ9NZC4 300 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LRP5LA4QPB2 252 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 H0YIZ8 118 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZZEF1O43149 2961 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MLNRO43193 412 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 WDR1O75083 606 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLATP00750 562 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA6P05013 189 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PGA5P0DJD9 388 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5H8P0DN80 308 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 S100A1P23297 94 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GLRA1P23415 457 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SSTR2P30874 369 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OPRM1P35372 400 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TIMP3P35625 211 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MPV17P39210 176 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ECI1P42126 302 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 HAAOP46952 286 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF81P51508 661 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GPM6AP51674 278 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ERVS71-1P61550 626 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IL13RA1P78552 427 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PSG7Q13046 419 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF345Q14585 488 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 HERPUD1Q15011 391 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MSMPQ1L6U9 139 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CLLU1Q5K131 121 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR2T2Q6IF00 324 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZR03 302 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM17Q86X19 198 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF573Q86YE8 665 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MKXQ8IYA7 352 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LRTM2Q8N967 370 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 POC1AQ8NBT0 407 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EXTL1Q92935 676 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLAMF9Q96A28 289 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms