RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RABAC1Q9UI14 185 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00527Q9UJ94 153 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC25A13Q9UJS0 675 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 FUT9Q9Y231 359 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SNX5Q9Y5X3 404 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 UACAQ9BZF9 1416 aa-2.59□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 A0A087WX48 190 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf86A6NJI1 115 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KNCNA6PVL3 124 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CENPBD1B2RD01 187 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 M0R1B8 84 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFA4O00483 81 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RNF13O43567 381 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ORC4O43929 436 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SPAG7O75391 227 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CABYRO75952 493 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 AKR7A3O95154 331 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CRTAMO95727 393 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TCL1BO95988 128 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CRYAAP02489 173 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C3orf79P0CE67 100 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM18P0DKX4 95 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CALCBP10092 127 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 COX8AP10176 69 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SCGB1A1P11684 91 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MTHFD2P13995 350 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IFNGR1P15260 489 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TBXA2RP21731 343 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CRYBB3P26998 211 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HTR7P34969 479 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GABRA4P48169 554 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PDE6CP51160 858 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BMXP51813 675 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DLX6P56179 175 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DCDC1P59894 354 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2B8PP59922 312 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1CAP62136 330 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HERV-K104P63124 156 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GTF2IP78347 998 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ID2Q02363 134 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PDZK1IP1Q13113 114 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RAB33AQ14088 237 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GPR176Q14439 515 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MFSD13AQ14CX5 517 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TAF13Q15543 124 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GRK1Q15835 563 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KCNMB1Q16558 191 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SV2CQ496J9 727 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GPR33Q49SQ1 333 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP-2.6□□□□□ -2.831e-58■□□□□ 10.1
SNORD54-201ENST00000459159 RUNDC3AQ59EK9 446 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RNF20Q5VTR2 975 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HBMQ6B0K9 141 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR8G2PQ6IF36 304 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NCEH1Q6PIU2 408 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 AGTRAPQ6RW13 159 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SCIMPQ6UWF3 145 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BTNL3Q6UXE8 466 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC9B2Q86UD5 537 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PIM3Q86V86 326 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 AMN1Q8IY45 258 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 EID3Q8N140 333 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2L13Q8N349 312 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GALNT16Q8N428 558 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PARP16Q8N5Y8 322 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CEP112Q8N8E3 955 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 COX18Q8N8Q8 333 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NUDT10Q8NFP7 164 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN14Q8NG11 270 aa-2.6□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC110Q8TBZ0 833 aa-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms