RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452545.1

ABCB6-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), human

TSL 4

Gene ABCB6, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB6-206	ENST00000452545	OR3A1	P47881	315 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF146	Q15072	292 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	ZAR1L	A6NP61	321 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	TOR1A	O14656	332 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	SH2D1B	O14796	132 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	SULT1C4	O75897	302 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	MTCP1	P56278	107 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	CDC42	P60953	191 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	EFNB1	P98172	346 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	CD69	Q07108	199 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCB6-206	ENST00000452545		M0QZK8	103 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	GYG2	O15488	501 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	APOL3	O95236	402 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OCM2	P0CE71	109 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PRKACB	P22694	351 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	EPHA2	P29317	976 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	MNDA	P41218	407 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OR2H2	O95918	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF20	P17024	532 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ATF1	P18846	271 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	HTR1F	P30939	366 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OR3A4P	P47883	348 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	GLIPR1	P48060	266 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PRRX1	P54821	245 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	AES	Q08117	197 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OSR2	Q8N2R0	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	CORO2A	Q92828	525 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	POMP	Q9Y244	141 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545		G3V2T6	193 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	AMY1A	P04745	511 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	AMY2A	P04746	511 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF44	P15621	663 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	CD34	P28906	385 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	GDNF	P39905	211 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PTGFR	P43088	359 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	SCN1B	Q07699	218 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	FGGY	Q96C11	551 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ABCB6-206	ENST00000452545	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms