RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMD7P51665 324 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FABP5Q01469 135 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRTM1Q86UE6 522 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDFY2Q96P53 400 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DYSFO75923 2080 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CR1P17927 2039 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NJY4 79 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R1W7 72 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGST3O14880 152 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2H2O95918 312 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSN2P05814 226 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP9P14780 707 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADRA2CP18825 462 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABRR1P24046 479 aa12.62□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLMHQ13867 455 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCD1Q15116 288 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf100Q5SVJ3 147 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AWAT2Q6E213 333 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSR2Q8N2R0 312 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUL1Q969V5 352 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRPDQ9H106 197 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFT22Q9H7X7 185 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL36RNQ9UBH0 155 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PQ09 198 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM82A0PJX8 343 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FUOMA2VDF0 154 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BUI4 141 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEGS1O15121 323 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOX4O94842 621 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDRT1O95170 752 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTR3BO95264 441 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF44P15621 663 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP1P28562 367 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNJ3P48549 501 aa12.61□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRK1Q15835 563 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPV17LQ2QL34 196 aa12.61□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGFRL1Q8N441 504 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CITED4Q96RK1 184 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP50Q9UKX7 468 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED13LQ71F56 2210 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZANQ9Y493 2812 aa12.61□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPE2 198 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PR64 198 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PRV1 198 aa12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FPR2P25090 351 aa12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM11P57052 281 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARF6P62330 175 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A6Q4U2R8 563 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6P435 159 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6M1Q8NGM8 313 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CST11Q9H112 138 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPACA1Q9HBV2 294 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST3GAL6Q9Y274 331 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 hADV38S2A0JD32 116 aa12.59□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A16PA6NEW6 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A7PA6NKC0 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A22PA8MWA6 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A12PA8MX19 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRPB1O00241 398 aa12.59□□□□□ -0.39
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