RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-206ENST00000368215 SARAFQ96BY9 339 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 OR5B12Q96R08 314 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-206ENST00000368215 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-206ENST00000368215 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 IGSF11Q5DX21 431 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CST9LP1Q5W188 147 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRK-206ENST00000368215 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM100Q9NV29 134 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TTLL8A6PVC2 850 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CDIPTO14735 213 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HBE1P02100 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 P2RY4P51582 365 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM50BP56557 158 aa7.36□□□□□ -1.23
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