RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 BCL2P10415 239 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FOLR1P15328 257 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PAX1P15863 534 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PNLIPP16233 465 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 KLK2P20151 261 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FGF7P21781 194 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 AADACP22760 399 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ANOS1P23352 680 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 DDTP30046 118 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 OPRM1P35372 400 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PTGDSP41222 190 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 VEGFBP49765 207 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 DYNLT3P51808 116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEBPGP53567 150 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CLDN17P56750 224 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAS2R30P59541 319 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAS2R60P59551 318 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ERVFRD-1P60508 538 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAB4BP61018 213 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCL20P78556 96 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 H3F3AP84243 136 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FOXO1Q12778 655 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 IL24Q13007 206 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 MALLQ13021 153 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CHAF1BQ13112 559 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 GAMTQ14353 236 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAB35Q15286 201 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SHBQ15464 509 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 EXT1Q16394 746 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAF9Q16594 264 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 HAGHQ16775 308 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TSPO2Q5TGU0 170 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM42Q69YG0 159 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 OR2T2Q6IF00 324 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CDPF1Q6NVV7 123 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 Q6ZS49 121 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 KMT5CQ86Y97 462 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLXDC1Q8IUK5 500 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF695Q8IW36 515 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CMTM1Q8IZ96 169 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM252Q8N6L7 170 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC35G3Q8N808 338 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FADS6Q8N9I5 356 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 IL22RA2Q969J5 263 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 NABP1Q96AH0 204 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF799Q96GE5 643 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 REEP6Q96HR9 211 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM210BQ96KR6 192 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 RHOVQ96L33 236 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM56Q96MV1 263 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TECTBQ96PL2 329 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TP53RKQ96S44 253 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATP5SQ99766 215 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CTDSP1Q9GZU7 261 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM222Q9H0R3 208 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLSCR2Q9NRY7 297 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 GLRX2Q9NS18 164 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPR173Q9NS66 373 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CD207Q9UJ71 328 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF391Q9UJN7 358 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 CYP8B1Q9UNU6 501 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC7A11Q9UPY5 501 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD56.3-201ENST00000363507 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms