RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2NLQ5JXB2 153 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM215Q68D42 235 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00596Q86U02 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4Z1Q86W10 505 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAPTQ8N292 157 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF321PQ8N8H1 164 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4A15Q8NGL6 344 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6N2Q8NGY6 317 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51Q1Q8NH59 317 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOK4Q8TEW6 326 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5P3Q8WZ94 311 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 YPEL4Q96NS1 127 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCL7BQ9BQE9 202 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHOFQ9HBH0 211 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM106BQ9NUM4 274 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAPAQ9P0L0 249 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA10Q9UJ72 324 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 V9GYY9 64 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TVP23AA6NH52 213 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 F5H5P2 479 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAPBO95292 243 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRGV3P03979 118 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CECR9P0C854 216 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAG3L2P0CL84 134 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTR2CP28335 458 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB103AP81534 67 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM241Q24JQ0 296 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM16Q2WEN9 425 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCOTHQ58A44 107 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP82Q8N141 532 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF738Q8NE65 137 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13C9Q8NGT0 318 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2K2Q8NGT1 345 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 MITD1Q8WV92 249 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 C22orf15Q8WYQ4 148 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYURFQ96I23 114 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADTRPQ96IZ2 230 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM6SF2Q9BZW4 377 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKHQ9HCJ1 492 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOT13Q9NPJ3 140 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO9BQ13459 2157 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOS1P29475 1434 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRCAMQ92823 1304 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0B4J2C4 111 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GU33 70 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MWP4 228 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 E7EWF7 191 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EN84 100 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFXANKO14593 260 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 FFAR1O14842 300 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1D-33P01593 117 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-33P01594 117 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD8AP01732 235 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRB1P04280 392 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCGB1C2P0DMR2 95 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNTFRP26992 372 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELK4P28324 431 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL12BP29460 328 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 BNIP2Q12982 314 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS2Q13268 280 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR176Q14439 515 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLYATQ6IB77 296 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF773Q6PK81 442 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PID1Q7Z2X4 250 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYZL2Q7Z4W2 148 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPPA2Q7Z7J5 298 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT10Q86SR1 603 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYPD6Q86Y78 171 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM58AQ8N1B3 248 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATPAF2Q8N5M1 289 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6K2Q8NGY2 324 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCGB1C1Q8TD33 95 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIB3Q96RU7 358 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT4Q9H2B2 425 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA1Q9HB21 404 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 VCX3AQ9NNX9 186 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDHAF2Q9NX18 166 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A14Q9Y267 594 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF337Q9Y3M9 751 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 FADS3Q9Y5Q0 445 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICE1Q9Y2F5 2266 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GXF2 115 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBFOX3A6NFN3 312 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms