RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 C1SP09871 688 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 IRS1P35568 1242 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB561P49447 251 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PRDX4Q13162 271 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PECRQ9BY49 303 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR84Q9NQS5 396 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NAGKQ9UJ70 344 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 INSL4Q14641 139 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCA2BQ16661 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 METRNLQ641Q3 311 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4S2Q8NH73 311 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP16P51512 607 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CTSCP53634 463 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 P01737 135 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PPICP45877 212 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SFRP2Q96HF1 295 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NCKAP5O14513 1909 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CTAG2O75638 210 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CCL5P13501 91 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TREM2Q9NZC2 230 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GFYI3L273 518 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHA1P01876 353 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHA2P01877 340 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NTHL1P78549 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF385BQ569K4 471 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 EDDM3BP56851 147 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 POLEQ07864 2286 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF716A6NP11 495 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM14Q96QK8 99 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2W5A6NFC9 320 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PLPP1O14494 284 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGESO14684 152 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2J2O76002 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 B3GALT4O96024 378 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CD1CP29017 333 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 EDDM3AQ14507 147 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GW15 77 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GNG10P50151 68 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNG5Q9UF02 275 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXL17Q9UF56 701 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR37O15354 613 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 EFSO43281 561 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MVDP53602 400 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 Q96M85 177 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB33BQ9H082 229 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ASB1Q9Y576 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 NEURL1O76050 574 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SDF2Q99470 211 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TSC2P49815 1807 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CXCL2P19875 107 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SKP2Q13309 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 TWIST1Q15672 202 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 CLN8Q9UBY8 286 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms