RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 POC1AQ8NBT0 407 aa13.6□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 STARD10Q9Y365 291 aa13.6□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.58□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 LAMP3Q9UQV4 416 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PPQ1 181 aa13.58□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 PRF1P14222 555 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF154Q13106 437 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 PRDX4Q13162 271 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 VASH2Q86V25 355 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR10D3Q8NH80 312 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CER1O95813 267 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 DLK1P80370 383 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CDS2O95674 445 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-GP17693 338 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-DRB3P79483 266 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SVILO95425 2214 aa13.56□□□□□ -0.24
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