RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 DEGS2Q6QHC5 323 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-201ENST00000332175 CARFQ8N187 725 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF561Q8N587 486 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-201ENST00000332175 UCN2Q96RP3 112 aa19.75■□□□□ 0.75
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
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PTPRM-201ENST00000332175 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-201ENST00000332175 STARD10Q9Y365 291 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-201ENST00000332175 PHOX2AO14813 284 aa19.72■□□□□ 0.75
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PTPRM-201ENST00000332175 FRRS1LQ9P0K9 344 aa19.72■□□□□ 0.75
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PTPRM-201ENST00000332175 PRSS42Q7Z5A4 293 aa19.71■□□□□ 0.75
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PTPRM-201ENST00000332175 ZAR1Q86SH2 424 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 GPR35Q9HC97 309 aa19.7■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 MPC2O95563 127 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 BRS3P32247 399 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 TOMM20LQ6UXN7 152 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 WFDC3Q8IUB2 231 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 OR10A7Q8NGE5 316 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 RNF2Q99496 336 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 C21orf140B9A014 251 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 ADAP1O75689 374 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 CST2P09228 141 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 19
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PTPRM-201ENST00000332175 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A40Q8TBP6 338 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL17Q9UF56 701 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 CD300LDQ6UXZ3 194 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 MAP6Q96JE9 813 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 PLAC1Q9HBJ0 212 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 SPRED2Q7Z698 418 aa19.69■□□□□ 0.74
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