RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0J9YY10 115 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GW15 77 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 EGR3Q06889 387 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CYBAP13498 195 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ARID2Q68CP9 1835 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXA6P31267 233 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CCR5P51681 352 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 MGST2Q99735 147 aa10.04□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CPMP14384 443 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 EPHX3Q9H6B9 360 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC19A1P41440 591 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 HPXP02790 462 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 LYZP61626 148 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 RTP2Q5QGT7 225 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 PELI1Q96FA3 418 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 SYT11Q9BT88 431 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 TBX21Q9UL17 535 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF766Q5HY98 468 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 PERPQ96FX8 193 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 DUSP13Q9UII6 198 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 MOB3BQ86TA1 216 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 PFN4Q8NHR9 129 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 WNT5BQ9H1J7 359 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 CES1P1Q9UKY3 287 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 HLA-GP17693 338 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 GDE1Q9NZC3 331 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 FOLR2P14207 255 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ROM1Q03395 351 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 HLA-DRB1P01911 266 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 GABRA1P14867 456 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5M9Q8NGP3 310 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 JAM3Q9BX67 310 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 FUT7Q11130 342 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.03□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 RER1O15258 196 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR84Q9NQS5 396 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB25P24278 435 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 SIRPB1O00241 398 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 GFRA2O00451 464 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 STPG2Q8N412 459 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.02□□□□□ -0.8
HDGFL3-201ENST00000299633 HMX2A2RU54 273 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 HTN1P15515 57 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PRTGQ2VWP7 1150 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 EMC4Q5J8M3 183 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf40Q8WZ69 217 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB1CQ92928 201 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ISL2Q96A47 359 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 KIR2DS3Q14952 304 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM64Q6YI46 380 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 HTR3DQ70Z44 454 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SYT8Q8NBV8 401 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C12orf49Q9H741 205 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TINAGQ9UJW2 476 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 IFITM5A6NNB3 132 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MOSPD3O75425 235 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5AC1P0C628 307 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 AVPR2P30518 371 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf128Q5T292 105 aa10.02□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms