RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CHST1O43916 411 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 RAB4BP61018 213 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CCL20P78556 96 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MST1LQ2TV78 715 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MKXQ8IYA7 352 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PSMF1Q92530 271 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 VCANP13611 3396 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SPTA1P02549 2419 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PPP5D1E7EU14 171 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TSPAN2O60636 221 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TCN2P20062 427 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FAM166AQ6J272 317 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PTX4Q96A99 478 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM8Q96KF7 97 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 RNF150Q9ULK6 438 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C9J4A7 227 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 F8VVB4 439 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 F8VWA3 439 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 YKT6O15498 198 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 HBE1P02100 147 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 P2RY1P47900 373 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 RTL6Q6ICC9 239 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TRAPPC2LH3BP13 241 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ISG15P05161 165 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PGA4P0DJD7 388 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PGA5P0DJD9 388 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SERPINA7P05543 415 aa12.65□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 RND3P61587 244 aa12.65□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 COMMD1Q8N668 190 aa12.65□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 RSG1Q9BU20 258 aa12.65□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 WIPF3A6NGB9 483 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CXCL13O43927 109 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2G2P60604 165 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 DCDP81605 110 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FAM3AP98173 230 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 BTNL8Q6UX41 500 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR4F5Q8NH21 305 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MRGPRFQ96AM1 343 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR4F4Q96R69 305 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 C5orf52A6NGY3 159 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SEC11BP0C7V7 166 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-BQ31612 363 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SPINK9Q5DT21 86 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 EXTL1Q92935 676 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MALSU1Q96EH3 234 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ABCA1O95477 2261 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HEXAP06865 529 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR8U8P0C7N1 319 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR10S1Q8NGN2 331 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PP6455Q8WZ26 134 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MRGPRX4Q96LA9 322 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OPA3Q9H6K4 179 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FCGR3AP08637 254 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF32P17041 273 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 THBS4P35443 961 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-DRB3P79483 266 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SPNS3Q6ZMD2 512 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FTCDNL1E5RQL4 147 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 P04436 131 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CELA2AP08217 269 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ECI1P42126 302 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GABRA4P48169 554 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 BAXQ07812 192 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HYAL1Q12794 435 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SLC39A7Q92504 469 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GPM6AP51674 278 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CEACAM16Q2WEN9 425 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SNAI3Q3KNW1 292 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GAPTQ8N292 157 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SLC7A10Q9NS82 523 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OSGIN2Q9Y236 505 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SEC14L6B5MCN3 397 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CHRNA7P36544 502 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TGFBR3Q03167 851 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms