RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 DDI2Q5TDH0 399 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 HACD4Q5VWC8 232 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 MKXQ8IYA7 352 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 UFD1Q92890 307 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 MAP6Q96JE9 813 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 MICU1Q9BPX6 476 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.66□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 A6NDX4 124 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 UNC119BA6NIH7 251 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 SYNGR1O43759 233 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 LMO1P25800 156 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 NOS3P29474 1203 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 HTR1FP30939 366 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 GABRA2P47869 451 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 RAB13P51153 203 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 PRKXP51817 358 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 TMEM219Q86XT9 240 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 SPSB4Q96A44 273 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 NLKQ9UBE8 527 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 V9GYH0 126 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 RYR2Q92736 4967 aa9.65□□□□□ -0.86
SPC25-201ENST00000282074 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 OR2AT4A6NND4 320 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ARPC3O15145 178 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ZFPL1O95159 310 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SLC2A1P11166 492 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 S100A1P23297 94 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SDC2P34741 201 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 OMPP47874 163 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 FXYD6P3P58550 94 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R43P59537 309 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 FAM3AP98173 230 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SNAPC1Q16533 368 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 PLA1AQ53H76 456 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 MZT2AQ6P582 158 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 FTMTQ8N4E7 242 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 OR4K13Q8NH42 304 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 MALSU1Q96EH3 234 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 KCNJ15Q99712 375 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SOSTQ9BQB4 213 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SRRQ9GZT4 340 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 LRP12Q9Y561 859 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TENM2Q9NT68 2774 aa9.64□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 FAM172BPA6NC97 362 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TMEM210A6NLX4 147 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 AKR7A2O43488 359 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 RHBDL1O75783 438 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 KRT8P05787 483 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 COX7A1P24310 79 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SLC6A6P31641 620 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 CAPZA1P52907 286 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A1P53007 311 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ERVFRD-1P60508 538 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 BLCAPP62952 87 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 OR2T33Q8NG76 320 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 ABCB9Q9NP78 766 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 CENPMQ9NSP4 180 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 OR6C68A6NDL8 312 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 HMX3A6NHT5 357 aa9.63□□□□□ -0.87
SPC25-201ENST00000282074 IDH3BO43837 385 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms