RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 IGSF23A1L1A6 192 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CD63P08962 238 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 NTF4P34130 210 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 MALLQ13021 153 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CALHM1Q8IU99 346 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 OR5C1Q8NGR4 320 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 MR1Q95460 341 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SYT3Q9BQG1 590 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 R4GN57 208 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2KP61086 200 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RPS18P62269 152 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 S100A12P80511 92 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF92Q03936 586 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 HMGN3Q15651 99 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 KCNMB1Q16558 191 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM123Q8N131 208 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 OR2C3Q8N628 320 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ADAM20O43506 726 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 C4orf17Q53FE4 359 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 UBALD1Q8TB05 177 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 OR51B6Q9H340 312 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 POMT1Q9Y6A1 747 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF724A8MTY0 619 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 AP4M1O00189 453 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 WRBO00258 174 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 LY86O95711 162 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 FOLR2P14207 255 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 GINS3Q9BRX5 216 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF154Q13106 437 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZPA2 131 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 BCO1Q9HAY6 547 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 H3BQ15 152 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 PPYP01298 95 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ECI1P42126 302 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ALDH3B1P43353 468 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 TBC1D26Q86UD7 250 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZIC4Q8N9L1 334 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 DNAJC13O75165 2243 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0G2JMM0 328 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PPB8 328 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PRS3 328 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 KIR3DP1A8MWS1 328 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CXCL13O43927 109 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 DYNLT3P51808 116 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 TSC22D1Q15714 1073 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM171Q8WVE6 324 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RAB39BQ96DA2 213 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 C18orf12Q96KH6 178 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 A0A096LPE4 126 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PPZ6 126 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 IFNA17P01571 189 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 HLA-HP01893 362 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 SCTP09683 121 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 TCN2P20062 427 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RND3P61587 244 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 RTL6Q6ICC9 239 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 PRR18Q8N4B5 295 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF611Q8N823 705 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 BOD1Q96IK1 185 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 MPPED1O15442 326 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZIC3O60481 467 aa13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms