RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000247225.6

SGPP1-201, Transcript of sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGPP1, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1-201ENST00000247225 IL15RAQ13261 267 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 TMEM187Q14656 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 SHBQ15464 509 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 RARRES3Q9UL19 164 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 TRGC2P03986 189 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 CCL3P10147 92 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 EDN3P14138 238 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 THBS4P35443 961 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 MALLQ13021 153 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 MPV17LQ2QL34 196 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 OR2C3Q8N628 320 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 CHST5Q9GZS9 411 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.65□□□□□ -0.06
SGPP1-201ENST00000247225 HS3ST1O14792 307 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 MSTNO14793 375 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 FABP4P15090 132 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF32P17041 273 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 P2RY1P47900 373 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 DYNLT3P51808 116 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 DLK1P80370 383 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF429Q86V71 674 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 DOK5Q9P104 306 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CXorf65A6NEN9 183 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 IAPPP10997 89 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RND3P61587 244 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 STARD10Q9Y365 291 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 IGKV1D-12P01611 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CXCL1P09341 107 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RHEBQ15382 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 HLA-BQ31612 363 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SGCZQ96LD1 299 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 HSF4Q9ULV5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.64□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 A0A1W2PR77 199 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 IGSF23A1L1A6 192 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 UBE2CO00762 179 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 S100A12P80511 92 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RDH5Q92781 318 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 Q96M66 194 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 PRF1P14222 555 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 AGAP20933 346 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 BMP5P22003 454 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 OSR2Q8N2R0 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 FAM157AC9JC47 383 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SCTP09683 121 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 DEFA6Q01524 100 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 RNF212Q495C1 297 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 STX12Q86Y82 276 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF488Q96MN9 340 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 OR51M1Q9H341 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CHST1O43916 411 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 GLB1P16278 677 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 PP6455Q8WZ26 134 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 HMGN3Q15651 99 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 OR2T2Q6IF00 324 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CALHM1Q8IU99 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 GAPTQ8N292 157 aa14.62□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 AQP7P3A6NL99 342 aa14.61□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 HSPA12AO43301 675 aa14.61□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 CXCL13O43927 109 aa14.61□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGPP1-201ENST00000247225 SEC11BP0C7V7 166 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms