RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246891.8

CSN1S1-201, Transcript of casein alpha s1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN1S1, Length 985 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1-201ENST00000246891 BORCS5Q969J3 196 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 GPR137Q96N19 417 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 EMC6Q9BV81 110 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TMED9Q9BVK6 235 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 HES7Q9BYE0 225 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SYT4Q9H2B2 425 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 RERGLQ9H628 205 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SSR3Q9UNL2 185 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 MOKQ9UQ07 419 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 FKBP7Q9Y680 259 aa3.3□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CFAP54Q96N23 3096 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 A0A1W2PNV4 684 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 A0A1W2PRG6 482 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 C21orf140B9A014 251 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 H0YC42 278 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC16A7O60669 478 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CYTIPO60759 359 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CBR3O75828 277 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 RENP00797 406 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ICAM2P13598 275 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SPNP16150 400 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CNR1P21554 472 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 DPP4P27487 766 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CD40LGP29965 261 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 KIR3DL2P43630 455 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 STARP49675 285 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TNFSF10P50591 281 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 RORCP51449 518 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR2B6P58173 313 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR10A3P58181 314 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ACTC1P68032 377 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ACTA1P68133 377 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 HSF2Q03933 536 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 MXD1Q05195 221 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 FMODQ06828 376 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 PUDPQ08623 228 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 IL24Q13007 206 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF846Q147U1 533 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC17A1Q14916 467 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OPCMLQ14982 345 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF146Q15072 292 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CDK5R1Q15078 307 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF79Q15937 498 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 CARTPTQ16568 116 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TEX30Q5JUR7 227 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 LIPNQ5VXI9 398 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ARL9Q6T311 187 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 TMEM156Q8N614 296 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR2T4Q8NH00 348 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 OTOSQ8NHW6 89 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 FNDC8Q8TC99 324 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 S100ZQ8WXG8 99 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 DDIT4LQ96D03 193 aa3.29□□□□□ -1.88
CSN1S1-201ENST00000246891 KCTD7Q96MP8 289 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms