RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1138Q8VFQ9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr51Q8VGG9 307 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem126bQ9D1R1 230 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4933421I07RikQ9D420 214 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Galnt16Q9JJ61 558 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Foxe3Q9QY14 288 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MpdzQ8VBX6 2055 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Esp36G3UZD8 160 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tnfrsf17O88472 185 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tgfb1P04202 390 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SrgnP13609 152 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Foxa3P35584 353 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CycsP62897 105 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dlk1Q09163 385 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Amz2Q400C8 359 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q5XFZ0 217 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Igsf21Q7TNR6 468 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr728Q7TRM6 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Itln1bQ80ZA0 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rnf122Q8BP31 155 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r28Q8R2C9 302 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Steap4Q923B6 470 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mpv17lQ99MS3 194 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Necap1Q9CR95 275 aa8.35□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1438-ps1A0A140LHS9 319 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr248E9Q1L6 309 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Oosp3G5E8D7 195 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rdh5O55240 318 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sigmar1O55242 223 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CcnoP0C242 352 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcsk4P29121 655 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 UbdP63072 162 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 F7P70375 446 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gnb3Q61011 340 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ceacam14Q78Y72 263 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc38a9Q8BGD6 560 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5148Q8BGG2 154 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxw26Q8BI58 466 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Parp11Q8CFF0 331 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prrg2Q8R182 198 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r212Q8R268 357 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nfam1Q8R4V1 264 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr480Q8VEZ0 312 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1440Q8VFV4 315 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr583Q8VG25 319 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adam33Q923W9 797 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a10Q99N03 267 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PirQ9D711 290 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q9D727 114 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dpep3Q9DA79 493 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cldn15Q9Z0S5 227 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alkal1J3QPP8 127 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 P01896 185 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CtsbP10605 339 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fgf5P15656 264 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pou2f3P31362 431 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gfi1P70338 423 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wbp1P97764 304 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Agbl4Q09LZ8 540 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rtl6Q505G4 243 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DbhQ64237 622 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrp10Q7TQH7 713 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1167Q7TR26 316 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr591Q7TRR7 314 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr198Q7TS40 306 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clec2hQ8C1T8 218 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prps1l1Q8C5R8 318 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Obp2aQ8K1H9 176 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stxbp6Q8R3T5 210 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nit1Q8VDK1 323 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1392Q8VFA6 311 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr99Q8VFE4 305 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1170Q8VFG1 316 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ly6kQ9CWP4 154 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MmachcQ9CZD0 279 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CsQ9CZU6 464 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rpl22l1Q9D7S7 122 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Chst4Q9R1I1 388 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RfxankQ9Z205 269 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BC025446A0A087WQT1 134 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm14412A2ARR7 526 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mrap2D3Z1Q2 207 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr743L7N1Y2 311 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 OtpO09113 325 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lhx3P50481 400 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ppp1ccP63087 323 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PmelQ60696 626 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr148Q60887 310 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf250Q7TNU6 535 aa8.34□□□□□ -1.07
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Crispld2Q8BZQ2 495 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40 ms