RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 PSG11Q9UQ72 335 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 COX7A2P2O60397 106 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC6A1P30531 599 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 PDCD1Q15116 288 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 LYG1Q8N1E2 194 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 GPA33Q99795 319 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 CHST5Q9GZS9 411 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ARID2Q68CP9 1835 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1W2PR77 199 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 TRDCB7Z8K6 153 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 CYTIPO60759 359 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 LIMS1P48059 325 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 SP6Q3SY56 376 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 BTNL8Q6UX41 500 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 CCL17Q92583 94 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 XKRY2A2RUG3 117 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP1R2P9O14990 202 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 CPN1P15169 458 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM123Q8N131 208 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 NMES1Q9C002 83 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 M0QZ24 198 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 MASP2O00187 686 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 AKR7A2O43488 359 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 OR2C1O95371 312 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 UQCC3Q6UW78 93 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 TEX261Q6UWH6 196 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 FZR1Q9UM11 496 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 GAB2Q9UQC2 676 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 STARD10Q9Y365 291 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 U3KQ87 197 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 NTN1O95631 604 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 C14orf79Q96F83 325 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 OOEPA6NGQ2 149 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 FCGR3BO75015 233 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 GZMHP20718 246 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 P2RX3P56373 397 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 FGF11Q92914 225 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 HES4Q9HCC6 221 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ADAM20O43506 726 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 RFESDQ8TAC1 157 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 DCTN6O00399 190 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 OR3A1P47881 315 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 ATP6V1FQ16864 119 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 CLLU1Q5K131 121 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0J9YW62 118 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 CST7O76096 145 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 Q3ZCU0 254 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 MITD1Q8WV92 249 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 NEURL2Q9BR09 285 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 TPPP3Q9BW30 176 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 HMSDA8MTL9 139 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 SP9P0CG40 484 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 BMI1P35226 326 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 C3AR1Q16581 482 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 OR2D2Q9H210 308 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF7Q9UBF6 113 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 V9GYH0 126 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0U1RQV5 110 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 H3BP45 60 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 SCGB1D1O95968 90 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 FOXO1Q12778 655 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 GABRA6Q16445 453 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 DVL1O14640 695 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 MPC2O95563 127 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms