RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 MED12Q93074 2177 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM157AC9JC47 383 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 MASP2O00187 686 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR5AC1P0C628 307 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PATE4P0C8F1 98 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 COX5BP10606 129 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 EDN3P14138 238 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TCN2P20062 427 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP1P28562 367 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 GFRA1P56159 465 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 RND3P61587 244 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SSPNQ14714 243 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 HMGN3Q15651 99 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIGYQ3MUY2 71 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACER2Q5QJU3 275 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIGCQ92535 297 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEPPQ9NTK1 212 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TCFL5Q9UL49 500 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCSK5Q92824 1860 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PATE3B3GLJ2 98 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DANCRP0C864 163 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 AADACP22760 399 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACP1P24666 158 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 LMO1P25800 156 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAX6P26367 422 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 OTX2P32243 289 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB5CP51148 216 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 HERV-K104P61576 105 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SRPXP78539 464 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXO1Q12778 655 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SP6Q3SY56 376 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q6ZPA2 131 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q6ZRG5 221 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 CT55Q8WUE5 264 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSMF1Q92530 271 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TOMM40LQ969M1 308 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERGIC1Q969X5 290 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIRREL1Q96J84 757 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 WFDC1Q9HC57 220 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 KPTNQ9Y664 436 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 LAMA3Q16787 3333 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GW64 132 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 PINLYPA6NC86 204 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRDCB7Z8K6 153 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 MPPED1O15442 326 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 ST8SIA3O43173 380 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SFTA3P0C7M3 94 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPP1P10451 314 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOLR2P14207 255 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 GDF1P27539 372 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNJ3P48549 501 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYB561P49447 251 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FXYD4P59646 89 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHV3-54-201ENST00000622166 DYRK2Q92630 601 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms