RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600155.1

LINC00649-211, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 1,108 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-211ENST00000600155 COPS3Q9UNS2 423 aa8.52□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HAND1O96004 215 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CSN2P05814 226 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MNDAP41218 407 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 P2RX3P56373 397 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CBX1P83916 185 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 EFNB1P98172 346 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF91Q05481 1191 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FLOT2Q14254 428 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 GRK1Q15835 563 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 UTS2BQ765I0 119 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CHST4Q8NCG5 386 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM163Q8TC26 289 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CORO2AQ92828 525 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 STMN2Q93045 179 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 RFKQ969G6 155 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF488Q96MN9 340 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 A0A087X0M5 115 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 A0A1B0GX30 115 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 METTL15A6NJ78 407 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 SH2D1BO14796 132 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FKBP6O75344 327 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 LMO1P25800 156 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 RAB13P51153 203 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HCCSP53701 268 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PRRX1P54821 245 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 GYS2P54840 703 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 BLCAPP62952 87 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM219Q86XT9 240 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 COMMD1Q8N668 190 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 THTPAQ9BU02 230 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ZAR1LA6NP61 321 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PRR32B1ATL7 298 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PRKYO43930 277 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 IGLV1-47P01700 117 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ISG15P05161 165 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 FAM106CPP0CH98 169 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 GABRR1P24046 479 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HTR1FP30939 366 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 UBE2V2Q15819 145 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 PLA1AQ53H76 456 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 C12orf73Q69YU5 71 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 SPATA24Q86W54 205 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 APOL4Q9BPW4 351 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 ZFP57Q9NU63 452 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM82A0PJX8 343 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 TOR1AO14656 332 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 MT-ND2P03891 347 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00649-211ENST00000600155 T-ENOLP0DO92 83 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms