RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MAP6Q96JE9 813 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GPX5O75715 221 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MAB21L1Q13394 359 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RHEBQ15382 184 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 KISS1Q15726 138 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PFDN5Q99471 154 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 P2RX4Q99571 388 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RFX2P48378 723 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 DTX1Q86Y01 620 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GPR31O00270 319 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GAMTQ14353 236 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OXA1LQ15070 435 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 HTRA1Q92743 480 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PRNDQ9UKY0 176 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 FCGR3BO75015 233 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 B3GALNT1O75752 331 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 UBE2G1P62253 170 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PKIBQ9C010 78 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 NEURL1O76050 574 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR10J4P0C629 311 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OPRK1P41145 380 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ATP5G2Q06055 141 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR4A47Q6IF82 309 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ISOC1Q96CN7 298 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR2A4O95047 310 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF205O95201 554 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IGHG3P01860 377 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF616Q08AN1 781 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GPX8Q8TED1 209 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR2A7Q96R45 310 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IL20Q9NYY1 176 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 DPM3Q9P2X0 92 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 CECR9P0C854 216 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 CTLA4P16410 223 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 HTR2BP41595 481 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 FOXL2P58012 376 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 Q3ZCU0 254 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 CDH26Q8IXH8 852 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MDS2Q8NDY4 140 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 RAB29O14966 203 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PSG4Q00888 419 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 BIVMQ86UB2 503 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM186Q96B77 213 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 CLN5O75503 358 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ACKR3P25106 362 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 GCAP28676 217 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 EPHA2P29317 976 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 SMIM19Q96E16 107 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PRORYQ9H606 182 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 PRELID1Q9Y255 219 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 MMD2Q8IY49 270 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 OR8U1Q8NH10 309 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 HARBI1Q96MB7 349 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 STARD10Q9Y365 291 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-208ENST00000590843 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 UTS2BQ765I0 119 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 SKA3Q8IX90 412 aa9.9□□□□□ -0.83
SEH1L-208ENST00000590843 STARD4Q96DR4 205 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms