RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576677.5

TBCD-222, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 1 (best)

Gene TBCD, Length 1,926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-222	ENST00000576677	IGLV1-44	P01699	117 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	AKR1C4	P17516	323 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	CD34	P28906	385 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	IL24	Q13007	206 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	PKIB	Q9C010	78 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	ACACA	Q13085	2346 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	CECR9	P0C854	216 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	SELE	P16581	610 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	OPRM1	P35372	400 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	MITD1	Q8WV92	249 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	EXTL1	Q92935	676 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	OR51I2	Q9H344	312 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	PSG7	Q13046	419 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	MPV17L	Q2QL34	196 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	OR5H14	A6NHG9	310 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	RGS11	O94810	467 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	VAMP1	P23763	118 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	MICU1	Q9BPX6	476 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	PLK3	Q9H4B4	646 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677		J3QT63	122 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	TDGF1P3	P51864	188 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	DHODH	Q02127	395 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677		Q8NA96	180 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	PHB2	Q99623	299 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-222	ENST00000576677	FAM221A	A4D161	298 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	TUBG1	P23258	451 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	BAMBI	Q13145	260 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	LINC00596	Q86U02	117 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM230	Q96A57	120 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	OR5H8	P0DN80	308 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	PPP3CB	P16298	524 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	PRKACA	P17612	351 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	CALCR	P30988	508 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	MPV17	P39210	176 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ECI1	P42126	302 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	LRP5L	A4QPB2	252 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	WDR86	Q86TI4	376 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF488	Q96MN9	340 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	RHOF	Q9HBH0	211 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	PLSCR5	A0PG75	271 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	RHBDL1	O75783	438 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	HLA-G	P17693	338 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	PI3	P19957	117 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF81	P51508	661 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	IKZF1	Q13422	519 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	NDUFA5	Q16718	116 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	LIN54	Q6MZP7	749 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677		Q6ZPA2	131 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	DECR2	Q9NUI1	292 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	ATM	Q13315	3056 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	IGFBP7	Q16270	282 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TBCD-222	ENST00000576677	SLC22A25	Q6T423	547 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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