RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.07■□□□□ 0.16
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SPNS3-204ENST00000575194 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 CRYABP02511 175 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 CBR1P16152 277 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 IL24Q13007 206 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 BAMBIQ13145 260 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SPNS3-204ENST00000575194 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.02■□□□□ 0.15
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