RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF273	Q14593	569 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RCN1	Q15293	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PNKD	Q8N490	385 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	KDM4B	O94953	1096 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CLIC3	O95833	236 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CCL3L1	P16619	93 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	IL18R1	Q13478	541 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TAF9	Q16594	264 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SULT1B1	O43704	296 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PRKACA	P17612	351 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	ETV1	P50549	477 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	EDDM3B	P56851	147 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	AANAT	Q16613	207 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-231	ENST00000566784	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PSPN	O60542	156 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	HCK	P08631	526 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	MYL12A	P19105	171 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	GABRR1	P24046	479 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ZP1	P60852	638 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	KISS1	Q15726	138 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	GRK1	Q15835	563 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	SH2D1B	O14796	132 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	MGST3	O14880	152 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OR2H2	O95918	312 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	CD2	P06729	351 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	RAB3A	P20336	220 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	LMO1	P25800	156 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	DUSP1	P28562	367 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TGFBR2	P37173	567 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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