RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CYB561	P49447	251 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	HERV-K104	P61576	105 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SKA3	Q8IX90	412 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD1	Q8N668	190 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PIGC	Q92535	297 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM45B	Q96B21	275 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ARV1	Q9H2C2	271 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	STARD10	Q9Y365	291 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MASP2	O00187	686 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	GPR137B	O60478	399 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SFTA3	P0C7M3	94 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	GDF1	P27539	372 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SRPX	P78539	464 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	IL13RA2	Q14627	380 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SP6	Q3SY56	376 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ESX1	Q8N693	406 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA7	P05543	415 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SEC11B	P0C7V7	166 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY1	P47900	373 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559		Q0VFX4	171 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SSPN	Q14714	243 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	HMGN3	Q15651	99 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRG5	221 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PATE3	B3GLJ2	98 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS44	E7EML9	344 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	NPBWR1	P48145	328 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	DYRK2	Q92630	601 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	WNT2B	Q93097	391 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ST8SIA3	O43173	380 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	GFRA1	P56159	465 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS12	P56730	875 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	BRICD5	Q6PL45	260 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF611	Q8N823	705 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559		Q8NFD4	153 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF175	Q9Y473	711 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM221A	A4D161	298 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	EDN3	P14138	238 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CD80	P33681	288 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RAB5C	P51148	216 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN15	P56746	228 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZS49	121 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	NAXE	Q8NCW5	288 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD3	Q8WU67	409 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ERGIC1	Q969X5	290 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	KIRREL1	Q96J84	757 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LAMTOR5	O43504	91 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN15	O95858	294 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RFC3	P40938	356 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	GINS3	Q9BRX5	216 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZPBP	Q9BS86	351 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		15.9	■□□□□ 0.14

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