RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 BMXP51813 675 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CAPZA1P52907 286 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PAX8Q06710 450 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 INSL4Q14641 139 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM203Q969S6 136 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 GLS2Q9UI32 602 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 HAND1O96004 215 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MAS1P04201 325 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SFTPBP07988 381 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRM2P08172 466 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PTGFRP43088 359 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 OR3A4PP47883 348 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MTNR1BP49286 362 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SCGB2A2Q13296 93 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF146Q15072 292 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RSU1Q15404 277 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ARMCX4Q5H9R4 360 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 NANPQ8TBE9 248 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PHYHIPQ92561 330 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 S100A13Q99584 98 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 OPN4Q9UHM6 478 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFHX3Q15911 3703 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MEGF11A6BM72 1044 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UCHL1P09936 223 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ADRA2CP18825 462 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 COL10A1Q03692 680 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM27D1Q5T7N8 215 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ELP2Q6IA86 826 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH26Q8IXH8 852 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 POM121Q96HA1 1249 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SLITRK2Q9H156 845 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 METRNQ9UJH8 293 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PQ09 198 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF737O75373 536 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ARL6IP5O75915 188 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFAIP8O95379 198 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TK1P04183 234 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CALCBP10092 127 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMB9P28065 219 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FGF12P61328 243 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SSX1Q16384 188 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UPRTQ96BW1 309 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 IL36GQ9NZH8 169 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 K7N7A8 449 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CCRL2O00421 344 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SH2D1BO14796 132 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CDRT1O95170 752 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 DUSP1P28562 367 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ASCL4Q6XD76 172 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 OR8H2Q8N162 312 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 KIR3DL3Q8N743 410 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL9Q9H1A3 318 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 TOX4O94842 621 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 FSHBP01225 129 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNA2P01563 188 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 SRMP19623 302 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 GABRR1P24046 479 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 FABP5Q01469 135 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CHST4Q8NCG5 386 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms