RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 SRRM5B3KS81 715 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 C3orf80F5H4A9 247 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 TMPRSS2O15393 492 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 PIN1P1O15428 100 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RGS5O15539 181 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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CS-218ENST00000550159 GIFP27352 417 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 OR3A4PP47883 348 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FGF12P61328 243 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 IL13RA1P78552 427 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 SCN1BQ07699 218 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 IKZF1Q13422 519 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 IL13RA2Q14627 380 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 MPV17LQ2QL34 196 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ZNF561Q8N587 486 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ZNF525Q8N782 197 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.118e-11■■■■■ 34.1
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CS-218ENST00000550159 ADAM20O43506 726 aa8.09□□□□□ -1.11
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CS-218ENST00000550159 ANGPTL7O43827 346 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 MPIG6BO95866 241 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 MGMTP16455 207 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RAB6AP20340 208 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 BCL3P20749 454 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 COL8A2P25067 703 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 CD80P33681 288 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 MNDAP41218 407 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 KCNJ3P48549 501 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 PITPNBP48739 271 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 NCS1P62166 190 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 GNB2P62879 340 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 P2RY14Q15391 338 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ZNF404Q494X3 552 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.09□□□□□ -1.11
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CS-218ENST00000550159 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ELP2Q6IA86 826 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 CALHM1Q8IU99 346 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 TEX29Q8N6K0 151 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 PTX4Q96A99 478 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ORAI1Q96D31 301 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 HMG20AQ9NP66 347 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 CLN8Q9UBY8 286 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-218ENST00000550159 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A0A0A6YYH2 397 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A6NJ64 397 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 FAM25AB3EWG3 89 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 FAM25CB3EWG5 89 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 FAM25GB3EWG6 89 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 H3BMQ9 156 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 FOXH1O75593 365 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 RHBDL1O75783 438 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 HAND1O96004 215 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 NDUFB7P17568 137 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ANOS1P23352 680 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PRDX2P32119 198 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 NR4A2P43354 598 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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