RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZNF626Q68DY1 528 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SPATA24Q86W54 205 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 BATF2Q8N1L9 274 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZNF714Q96N38 554 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR8B4Q96RC9 309 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ADI1Q9BV57 179 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PKIBQ9C010 78 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 AP4S1Q9Y587 144 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 AQP12BA6NM10 295 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ODF3BA8MYP8 253 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CYB5AP00167 134 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PEX2P28328 305 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 DYNLT3P51808 116 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ACTA2P62736 377 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 BLCAPP62952 87 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ACTG2P63267 376 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ACTC1P68032 377 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ACTA1P68133 377 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ROM1Q03395 351 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 IL24Q13007 206 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 EDDM3AQ14507 147 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SNX22Q96L94 193 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CEP19Q96LK0 163 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MNTQ99583 582 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.8□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 FUOMA2VDF0 154 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 A6NIN4 97 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 INMTO95050 263 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TTRP02766 147 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SLC2A5P22732 501 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 GABRR1P24046 479 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MPZP25189 248 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 HTR1DP28221 377 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 DLX6P56179 175 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CD83Q01151 205 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MS4A2Q01362 244 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 GRK1Q15835 563 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR52W1Q6IF63 320 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 Q8IYB0 196 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 OR8H2Q8N162 312 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 EME1Q96AY2 570 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 APOL4Q9BPW4 351 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 HES4Q9HCC6 221 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 R4GMQ9 66 aa6.79□□□□□ -1.32
TROAP-208ENST00000548817 V9GYS6 101 aa6.79□□□□□ -1.32
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