RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 RARRES2Q99969 163 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 C2orf72A6NCS6 295 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF724A8MTY0 619 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CXCL1P09341 107 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TLE4Q04727 773 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 RSU1Q15404 277 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR8G1Q15617 311 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 Q3ZCU0 254 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CARD17Q5XLA6 110 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR5R1Q8NH85 324 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SPTSSAQ969W0 71 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SGK3Q96BR1 496 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM56Q96MV1 263 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ADAMTS20P59510 1910 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 IGSF23A1L1A6 192 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR5H15A6NDH6 313 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR5H1A6NKK0 313 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TSTD3H0UI37 97 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PAX1P15863 534 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PTGDSP41222 190 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 MTCP1P56278 107 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 EXT1Q16394 746 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SLC35G3Q8N808 338 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR2M3Q8NG83 312 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 C14orf144Q96I85 54 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 DKKL1Q9UK85 242 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 C5orf63A6NC05 138 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 M0R135 149 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 GPR37O15354 613 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 LINC01565O15544 149 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 PNLIPP16233 465 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 FXYD4P59646 89 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 VAMP2P63027 116 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CCL20P78556 96 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 HLA-DRB3P79483 266 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SHBQ15464 509 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 Q6ZS49 121 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF799Q96GE5 643 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 SPSB2Q99619 263 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 RP1P56715 2156 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-202ENST00000542324 ZNF727A8MUV8 499 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 LMO7DNF2Z398 122 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 F5H5K5 113 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 H0YL77 283 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 MPPED1O15442 326 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 ST8SIA5O15466 376 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 OPRM1P35372 400 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-202ENST00000542324 CLDN17P56750 224 aa9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms