RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537320.5

TNC-211, Transcript of tenascin C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNC, Length 4,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNC-211ENST00000537320 IL34Q6ZMJ4 242 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CXXC4Q9H2H0 198 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TINAGQ9UJW2 476 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 BCL2L11O43521 198 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TTRP02766 147 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PGA3P0DJD8 388 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 COX6A1P12074 109 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 COX5AP20674 150 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 RAB7AP51149 207 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CHD5Q8TDI0 1954 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ANK1P16157 1881 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SFTPCP11686 197 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GNB2P62879 340 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PCOLCEQ15113 449 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ADIRFQ15847 76 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 FAM27BQ5VT28 67 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 C17orf78Q8N4C9 275 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 AMELYQ99218 206 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CDIPTO14735 213 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 VSIG8P0DPA2 414 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF79Q15937 498 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HAGHQ16775 308 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TMEM231Q9H6L2 316 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PSG11Q9UQ72 335 aa10□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 LNP1A1A4G5 178 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HRASP01112 189 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ARL16Q0P5N6 197 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 OR3A1P47881 315 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 EFNB2P52799 333 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SCGB2A2Q13296 93 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HES7Q9BYE0 225 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CHST5Q9GZS9 411 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GNG13Q9P2W3 67 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GNG10P50151 68 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 P2RX3P56373 397 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 FGF11Q92914 225 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 KCNK17Q96T54 332 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 RAB18Q9NP72 206 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 IL17BQ9UHF5 180 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PLA2G10O15496 165 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PNPP00491 289 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CD300CQ08708 224 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 TMEM123Q8N131 208 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SPICQ8N5J4 248 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 LHX4Q969G2 390 aa9.99□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 MS4A18H0YCH9 400 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HFEQ30201 348 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 MDP1Q86V88 176 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 LYG1Q8N1E2 194 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 RND1Q92730 232 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 C20orf202A1L168 122 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 YIF1AO95070 293 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ONECUT2O95948 504 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 PGA4P0DJD7 388 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 BCL3P20749 454 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 KIR2DS2P43631 304 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 CRYBA2P53672 197 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 UBE2G1P62253 170 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 NTNG2Q96CW9 530 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 MED30Q96HR3 178 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ADGRG7Q96K78 797 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 NAA60Q9H7X0 242 aa9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNC-211ENST00000537320 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms