RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF737	O75373	536 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	KDM4B	O94953	1096 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	HAND1	O96004	215 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CD1A	P06126	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CALCB	P10092	127 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PRKACA	P17612	351 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CEL	P19835	753 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ZP1	P60852	638 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	BLMH	Q13867	455 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382		Q499Y3	187 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SNX22	Q96L94	193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382		A0A1W2PPH5	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ALDOB	P05062	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DUSP1	P28562	367 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PPP3R1	P63098	170 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SLC35A2	P78381	396 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	BDH1	Q02338	343 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ACSM1	Q08AH1	577 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	BAMBI	Q13145	260 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DOC2B	Q14184	412 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SGCD	Q92629	289 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GPER1	Q99527	375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SH2D1B	O14796	132 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GPX5	O75715	221 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PRTN3	P24158	256 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	VHL	P40337	213 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	SPHAR	Q15513	63 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GABRP	O00591	440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PSPN	O60542	156 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	OR2H2	O95918	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	GABRR1	P24046	479 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	CRHBP	P24387	322 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	BDKRB2	P30411	391 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	BMX	P51813	675 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DLX1	P56177	255 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	EDDM3B	P56851	147 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	IRF3	Q14653	427 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CTSB-231	ENST00000534382	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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