RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 ORAI1Q96D31 301 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 SDSLQ96GA7 329 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 JMJD8Q96S16 334 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 GLS2Q9UI32 602 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PPK0 400 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PRD5 423 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PRF3 423 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PRM7 423 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SIRPB1O00241 398 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OGG1O15527 345 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RGS10O43665 173 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 VENTXO95231 258 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRM2P08172 466 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 EDDM3BP56851 147 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ERVK11-1P61568 191 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTG1P63261 375 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 PDCD1Q15116 288 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 KISS1Q15726 138 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 Q499Y3 187 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 DDI2Q5TDH0 399 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF144BQ7Z419 303 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SGCDQ92629 289 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX5Q96PT3 197 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OR14A2Q96R54 314 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TBX15Q96SF7 602 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A13Q99584 98 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SIRPDQ9H106 197 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 Q9H521 79 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 HES4Q9HCC6 221 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 KPTNQ9Y664 436 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PPH5 198 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM77I1YAP6 450 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 MT-ND2P03891 347 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 HSMCR30P0CW71 290 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 HILS1P60008 231 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 BAMBIQ13145 260 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RSU1Q15404 277 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SVOPQ8N4V2 548 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TMED9Q9BVK6 235 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 CHST6Q9GZX3 395 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ING3Q9NXR8 418 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0A6YYJ9 748 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 GABRPO00591 440 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SH2D1BO14796 132 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1D-12P01611 117 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV1-69P01742 117 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TK1P04183 234 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 MAS1P04201 325 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF44P15621 663 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 BDKRB2P30411 391 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 DLX1P56177 255 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 KLRD1Q13241 179 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 GRK1Q15835 563 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 OR5M11Q96RB7 305 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 HMG20AQ9NP66 347 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms