RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MICBQ29980 383 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRICD5Q6PL45 260 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00596Q86U02 117 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POM121Q96HA1 1249 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HES4Q9HCC6 221 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NLKQ9UBE8 527 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RELNP78509 3460 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2QL1A1L167 161 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OOEPA6NGQ2 149 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB27BO00194 218 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPB6O14558 160 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX4O60224 188 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCD6O75340 191 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GYPAP02724 150 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFF1P04155 84 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSG2P11465 335 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNB3P16520 340 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.277e-6■□□□□ 9.8
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRSS3P35030 304 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETV6P41212 452 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NR4A2P43354 598 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTH2RP49190 550 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5J2P56134 94 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM50BP56557 158 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP10-9P60411 292 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARFRP1Q13795 201 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF146Q15072 292 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPV17LQ2QL34 196 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8H2Q8N162 312 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MFSD4AQ8N468 514 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEK7Q8TDX7 302 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB1CQ92928 201 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMD4Q96H15 378 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABHD1Q96SE0 405 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOSTQ9BQB4 213 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PECRQ9BY49 303 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 V9GYH0 126 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTTNQ86VV8 2226 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ISPDA4D126 451 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2H2O95918 312 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV4-39P01824 125 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DQB1P01920 261 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD3GP09693 182 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTHLHP12272 177 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNASE1P24855 282 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHATP28329 748 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM33P57088 247 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNG2P59768 71 aa7.13□□□□□ -1.27
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