RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51I1Q9H343 314 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOJQ9H4E5 214 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EVA1AQ9H8M9 152 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKTIPQ9H8T0 292 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf10Q9HB07 376 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EMC7Q9NPA0 242 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPMQ9NSP4 180 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM14BQ9NUH8 114 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATPIF1Q9UII2 106 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D24Q9ULP9 559 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF232Q9UNY5 417 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AP3M1Q9Y2T2 418 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00588Q9Y4M8 146 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIMM22Q9Y584 194 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00312Q9Y6C7 94 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYQ6 96 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0D9SG52 128 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF320A2RRD8 509 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUOMA2VDF0 154 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM189A5PLL7 270 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM23A6NLE4 172 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C15orf61A6NNL5 157 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM220BPB1ANY3 271 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MFNGO00587 321 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRHO14718 337 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSD17B6O14756 317 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOCS1O15524 211 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAP1O75689 374 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TUSC2O75896 110 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXPH2O95156 264 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCHEP06276 602 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRNGP07510 517 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GUSBP08236 651 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTT2P0CG29 244 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTT2BP0CG30 244 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 T-ENOLP0DO92 83 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTLA4P16410 223 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNB3P16520 340 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBLN1P23435 193 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL3RAP26951 378 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNRHRP30968 328 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMO3P31513 532 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYCR1P32322 319 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTGFRP43088 359 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 REG1BP48304 166 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFPI2P48307 235 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPTEP56180 551 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL11P62913 178 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLCQ05315 142 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST3H3Q16695 136 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC36Q1X8D7 754 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01559Q495D7 138 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FFAR4Q5NUL3 377 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATAD3CQ5T2N8 411 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AP1ARQ63HQ0 302 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4A47Q6IF82 309 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ULK3Q6PHR2 472 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 REG3GQ6UW15 175 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTNL8Q6UX41 500 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF621Q6ZSS3 439 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINA11Q86U17 422 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ISCA2Q86U28 154 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 APRG1Q8IVJ8 170 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 STHQ8IWL8 128 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf53Q8IXP5 236 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IZUMO1Q8IYV9 350 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR6V1Q8N148 313 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NATD1Q8N6N6 113 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BVESQ8NE79 360 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52P1PQ8NH57 321 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO25Q8TCJ0 367 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf54Q8WWF1 131 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASB10Q8WXI3 467 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM37Q8WXS4 190 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDKL2Q92772 493 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGHQ92820 318 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPTSSAQ969W0 71 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTERF3Q96E29 417 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF170Q96K19 258 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS1Q96LJ7 313 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC42Q96M95 316 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM68Q96MH6 324 aa1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms