RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512677.1

PIK3R4-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PIK3R4, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	GGH	Q92820	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	NF1	P21359	2839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A1B0GUS0	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677		K7N7A8	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RHBDL1	O75783	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	KDM4B	O94953	1096 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CLIC3	O95833	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PAH	P00439	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PLAT	P00750	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	FSHB	P01225	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CRYBA1	P05813	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CSN2	P05814	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	FBP1	P09467	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	UBB	P0CG47	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRKACA	P17612	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	EGR1	P18146	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CEL	P19835	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRTN3	P24158	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	POU3F4	P49335	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ETV1	P50549	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	UBE2E1	P51965	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	LGALS4	P56470	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ARF6	P62330	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	BAMBI	Q13145	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RSU1	Q15404	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	MED22	Q15528	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	MIDN	Q504T8	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	GHSR	Q92847	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	UFD1	Q92890	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3R4-208	ENST00000512677	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms